内设学术机构系(系、所、中心、实验室)
基础医学系
护理系
预防医学系
病理学系
临床医学系
口腔医学系
医学影像系
医学检验系
医学人文研究所
教学实验中心
《农垦医学》编辑部
教学评估中心(教师发展中心)
学科发展中心
资产管理与招采中心
医学教育研究室
医学教学督导室
新疆地方与民族高发病教育部重点实验室
新疆地方性高发病国家国际科技合作基地
重要新发传染病防控与公共安全兵团重点实验室
伟德BETVlCTOR1946实验动物中心